ciao raga
ho installato ubuntu 12, la nuova versione presenta una novità, quando si apre un programma questi si integra con la barra di ubuntu e i menu del programma appaiono sulla barra di ubuntu.
avviando un mio programma fatto con gambas 3 anche questi si integra con la barra, solo che le voci dei menu appaiono 2 volte, una sulla barra di ubuntu e una sul mio programma.

come s fa a farli interagire con una sola voce oppure a non farli interagire affatto e i menu restano sul programma?

ciao, io non uso menu a discesa nei miei programmi, ma per quanto rigurad l'ide, che presentava lo stesso problema, ho selezionato la voce "hide menubar" dal menu "vista" e sono rimasti solo i menu della barra principale di ubuntu.

sulla ide funziona, come si fa ad impostare la stessa cosa sul progetto?

Perdonate l'ignoranza ma cosi non si nascondono i menu? In questo modo, su un sistema non ubuntu e che quindi non integri la global menu bar, tipo debian, ci si ritrova senza i menu?

La funzione della cattura dei menu nel pannello di Unity viene eseguita dalla libreria libappmenu.so che si trova nel direttorio:
/usr/lib/indicators3/6/  (Ubuntu 11.04 ed Ubuntu 11.10)
/usr/lib/indicators3/7/  (Ubuntu 12.04)
quindi ti basta verificare la presenza di tale libreria e decidere, di conseguenza, se nascondere o meno i menu.
Se poi sei pignolo (come lo sono io  ) puoi verificare che si tratti di Ubuntu con un cat di /etc/lsb-release.

PS: per chi fosse interessato è possibile tornare alla modalità classica dei menu con il comando:
dove x assume il valore 6 o 7 a seconda della versione di Ubuntu in uso, dopodichè è necessario effettuare nuovamente il login.