Non puoi aggiornare Gambas2 a Gambas3. Puoi altresì installare entrambe le versioni, che sono perfettamente indipendenti.
Per installare Gambas3 hai tre possibilità:
1. Utilizzare il PPA dei binary relativi alla stable
2. Utilizzare il PPA dei binary relativi alla versione di sviluppo
3. Installare da sorgenti la stabile (3.4.1) o la sviluppo.
Per le modalità:
http://gambas.sourceforge.net/en/main.html alla voce Compilation & Installation